Bordeaux : la plateforme d’histopathologie de l’université a inauguré son MACSima
Ecran de visualisation des analyses menées sur la solution MACSima de Miltenyi sur la plateforme d'histopathologie. © Hande Sena Kandemir, université de Bordeaux
L’université de Bordeaux dispose d’une plateforme d’histopathologie dans l’unité d’appui et de recherche TBMCore (unité labélisée Inserm, CNRS et université de Bordeaux). Fin novembre 2025, la plateforme a inauguré son MACSima de Miltenyi pour la détection de centaines de protéines sur un même tissu. Bienvenue dans la biologie spatiale.
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Avant de choisir sa solution, Thomas Daubon, responsable scientifique et Nathalie Dugot-Senant, responsable technique de la plateforme ont pris des contacts avec les industriels, notamment lors du congrès de l’AFH (Association française d’histotechnologie). Trois sociétés – Miltenyi, Leica et Akoya – ont présenté plus avant leurs solutions à l’équipe.
« Le choix du MACSima résulte d’une réflexion locale et collaborative : Un des atouts était que de nombreux anticorps déjà utilisés par les équipes d’ImmunoConcEpT et déjà validés en cytométrie étaient compatibles avec l’appareil. Cela permet un gain de temps et de budget pour les chercheurs », explique Thomas Daubon dans la présentation de la plateforme sur le site internet du département Sciences Biologiques et Médicales de l’université de Bordeaux.
Les solutions de Miltenyi
La biologie spatiale selon Miltenyi Biotec consiste à analyser les protéines et les ARN dans leur contexte tissulaire, afin de comprendre l’organisation cellulaire et les interactions complexes au sein des tissus.
- La plateforme MACSima permet un marquage hyperplex automatisé de plusieurs centaines de protéines sur une même lame. Basée sur la technologie MACSima Imaging Cyclic Staining (MICS), elle réalise des cycles successifs de coloration, d’imagerie et d’élution douce, préservant l’intégrité de l’échantillon tout au long du processus.
- Associée à RNAsky, la solution de détection d’ARN spatiale développée par Miltenyi Biotec, elle permet de combiner protéomique et transcriptomique spatiale sur un même échantillon, révélant l’hétérogénéité cellulaire et les microenvironnements tumoraux.
- Le logiciel MACS iQ View complète cette approche en permettant la visualisation, l’exploration et l’analyse quantitative des images générées par le MACSima, pour une interprétation fine des données spatiales.
Cette approche intégrée peut trouver des applications en recherche biomédicale, immunothérapie et médecine personnalisée, en fournissant des données spatiales et fonctionnelles indispensables à la compréhension des tissus complexes.
Le MACSima installé sur la plateforme d'histopathologie de l'université de Bordeaux dans le bâtiment Bordeaux Biologie Santé. @Hande Sena Kandemir, université de Bordeaux
Financement et accompagnement
C’est toujours l’un des principaux points d’achoppement de ce genre de projet d’investissement dans du matériel de pointe ; la plateforme a bénéficié de plusieurs sources de financement : Fédération des plateformes, programme RRI NewMoon de l’université de Bordeaux, Région Nouvelle-Aquitaine et d’un appel à projets « gros équipement » de la Ligue contre le cancer.
L’équipe de la plateforme a du se former et plusieurs semaines ont été nécessaires pour paramétrer et valider le fonctionnement de l’outil. Désormais la plateforme est prête pour accompagner les porteurs de projets – et il faut déjà réserver son créneau – et accueillera, courant 2026, des collaborateurs internationaux.
